Hoewel de RGS Referentiecode al impliciet het niveau aangeeft bevat elke RGS-code ook nog afzonderlijk een niveau aanduiding, te weten:

1. Balans c.q. resultatenrekening;
2. Hoofdrubriek;
3. Rubriek;
4. Rekening; het niveau van de grootboekrekening (het meest gebruikt).
5. Mutatie.

Onderstaand voorbeeld illustreert nog even de samenhang tussen het niveau (2 t/m 5) en de RGS-code:

In bovenstaand voorbeeld wordt niveau 5 (mutaties) overigens gebruikt voor rekeningen. Terwijl rekeningen thuishoren op niveau 4.

RGS MKB maakt overigens louter gebruik van RGS t/m niveau 4. Zodat sprake is van een zuiver rekeningschema, waarbij rekeningen en mutaties niet door elkaar lopen (niveau 4 en 5).